Осенью 2013 года в отношении Пугачева, покинувшего к тому времени Россию, было возбуждено первое уголовное дело. По данным следствия, Пугачев похитил 28 млрд руб., которые Банк России выделил Межпромбанку в качестве беззалоговых кредитов.

Позднее Пугачеву было предъявлено новое обвинение. Как установило следствие, в 2009 году Межпромбанк выдал 120 кредитов подконтрольным ему организациям на сумму 64 млрд руб. Кредиты были обеспечены 100% акций кипрской компании OPK Mining Limited, которая принадлежала Енисейской промышленной корпорации. Позже Пугачев расторг договоры о залоге, благодаря чему лишил Межпромбанк возможности обратить взыскание на кипрский актив.

Агентство по страхованию вкладов обратилось к властям Великобритании, куда переселился Пугачев, с просьбой арестовать его активы. В начале июня прошлого года британские власти согласились рассмотреть запрос об экстрадиции банкира на родину. Ему было запрещено покидать территорию Англии и Уэльса. Тем не менее в начале июля 2015 года Пугачев покинул Лондон, мотивируя это тем, что ему угрожают убийством, и уехал во Францию.

В конце июля в одной из пятизвездочных гостиниц Ниццы Пугачев дал интервью английской газете The Guardian, в котором заявил, что Владимир Путин планировал оставаться у власти до тех пор, пока не разбогатеет. Бизнесмен утверждал, что к концу своего первого президентского срока глава государства стал бояться того, что с ним могло бы случиться, если он уйдет из Кремля, и его внутренний круг убедил его остаться.

22 сентября пресс-секретарь главы государства Дмитрий Песков заявил, что претензии российских следственных органов к Пугачеву не связаны с его личными отношениями с Путиным. «Я бы здесь не смешивал эти две темы», — сказал представитель Кремля. Комментировать иск банкира к России он не стал.

11 февраля этого года Высокий суд Лондона приговорил Пугачева к тюремному заключению за неуважение к суду на два года.

Адвокаты Пугачева в свою очередь ходатайствуют о вынесении судебных решений о превентивном аресте имущества РФ за рубежом в качестве обеспечительных мер по его иску к России.